.jar uzantılı java uygulamaları genelde varsayılan Linux sürümlerinde çift tıklayarak çalıştırılamaz, sıkıştırılmış arşiv gibi davranır. Eğer bunlar çalıştırılabilir(executable) bir uygulama ise çalıştırmak için sırayla şunlar yapılır.

1.Terminal(Uçbirim) açılır.

2. cd komutlarıyla jar uzantılı dosyanın bulunduğu klasöre gidilir.

3. Şu kod yazılarak çalıştırma işlemi yapılır:

java -jar <dosya_ismi>.jar

Gayet kolay evde deneyebilirsiniz. Eğer uygulamaya parametre geçiliyorsa yine buradan yapılabilir. Mesela iki tane text dosyasını parametre olarak alan jar uygulamasının Linux ortamında çalıştırılması için:

java -jar <dosya_ismi>.jar parametre1.txt parametre2.txt